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Stellenangebot: Wissenschaftliche Mitarbeiter (m/w)<br><br>
Am Regionalen Rechenzentrum (RRZK) der Universität zu Köln ist im Rahmen des Projekts „Skalierbare HPC Lösungen zur Effizienten Genomanalyse“ (NGSgoesHPC) eine Stelle (39,83 Wochenstunden) einer wissenschaftliche Mitarbeiterin / eines wissenschaftlichen Mitarbeiters zum nächstmöglichen Zeitpunkt zu besetzen. Die Stelle ist bis zum 31.3.2014 befristet.
Ziel des vom BMBF geförderten Verbundprojekts NGSgoesHPC ist die Optimierung von Methoden im Bereich Next Generation Sequencings (NGS). NGS ist eine Schlüsseltechnologie zur Bestimmung von genetischen Informationen. Sie arbeiten in einem Projektteam mit, in dem Algorithmen und Anwendungen aus dem Bereich der Gensequenzierung (NGS) auf moderne und hochleistungsfähige Rechnerarchitekturen portiert werden. Die entwickelten hochparallelen Anwendungen können auf den am RRZK vorhandenen Plattformen wie beispielsweise CHEOPS (100 Teraflop/s Cluster) ausprobiert und analysiert werden. Angestrebte Plattformen sind hochskalierende Infiniband Cluster, NVIDIA-Cluster, sowie Systeme auf Intel MIC Architektur. Die durch das RRZK abzudeckenden Teilaufgaben umfassen:
Analyse und Design von Algorithmen und Anwendungen aus dem Bereich NGS auf Optimierungs/Parallelisierungs Potentiale
Parallelisierung/Optimierung von NGS Algorithmen
Test/Evaluierung/Dokumentation der Erstellten Lösung
Unterstützung der Konsortialleitung
Erwartet wird ein abgeschlossenes Hochschulstudium der Informatik, einem naturwissenschaftlichen oder einem informatikorientierten Fach, vorzugsweise mit einem der Schwerpunkte auf Parallele Algorithmen/ Rechnerarchitekturen oder Bioinformatik. Ferner werden praktische Erfahrungen mit der Programmiersprache C, sowie der Programmierung paralleler Anwendungen auf Basis von Threads, OpenMP, MPi und/oder CUDA vorausgesetzt.
Neben Erfahrungen mit wissenschaftlichen Anwendungen sind Erfahrungen in mehreren der folgenden Gebiete von Vorteil:
Praktische Erfahrung bei der Analyse und Parallelisierung von wissenschaftlichen Anwendungen (z.B. auf Basis von MPI, OpenMP, CUDA, u.a.)
Kenntnisse der Funktionsweise von NGS relevanten Algorithmen/Anwendungen (Assembly, Alignement)
Administration von IT-Infrastrukturen unter Unix/Linux
Gensequenzanalyse
Die Vergütung erfolgt bei Vorliegen der entsprechenden tariflichen Voraussetzungen nach Entgeltgruppe 13 TV-L. Die Bedingungen hierfür hängen von den Voraussetzungen im Einzelfall ab.
Bewerbungen schwerbehinderter Menschen sind besonders willkommen. Schwerbehinderter Menschen werden bei gleicher Eignung bevorzugt. Bewerbungen von Frauen werden ausdrücklich erwünscht. Frauen werden bei gleicher Eignung, Befähigung und fachlicher Leistung bevorzugt berücksichtigt, sofern nicht in der Person eines Mitbewerbers liegende Gründe überwiegen.
Bitte richten Sie Ihre schriftliche Bewerbung mit den üblichen Unterlagen bis zum 15.09.2011 mit dem Stichwort „NGSgoesHPC, HPC“ an:
Prof. Dr.-Ing. Ulrich Lang, Universität zu Köln. Zentrum für Angewandte Informatik, Robert-Koch-Str. 10
50931 Köln.
Für Auskünfte steht Ihnen Herr Viktor Achter (Tel. 0221/478-5343, vachter@uni-koeln.de) zur Verfügung. </body>]]>